2013年5月，环保部通报称，对污水处理设施未按要求建设运行的临泉厂等16家企业进行挂牌督办并责令限期整改。2013年7月，安徽省环保厅发布的《安徽省2013年二季度国控污染源监督性监测信息》显示，多次上黑榜的临泉厂总排口又被检测出总磷0.975m g/L、超标1倍，色度50、超标0.7倍。临泉厂等9家污水处理厂因此被安徽省环保厅挂牌督办，并要求有关市环保局应依法对企业立案查处，责令企业限期改正，确保污染物稳定达标排放，10月底前完成挂牌督办事项。2013年9月18日，阜阳市环保局发布的《排放废水企业环境违法行为信息公开表》称，因临泉厂2013年4月排放水污染物总磷和色度超标，被阜阳市环保局责令于当年9月6日前改正超标排放行为并处罚款。
2013年9月23日，淮北市环保局发布的《排放废水企业环境违法行为明细表》显示，国祯环保全资子公司淮北中联环水环境有限公司(以下简称“淮北中联环”)存在环境违法行为，处理处罚情况为“限期整改”。
《经济参考报》记者查阅国祯环保招股书发现，无论是环保部或安徽省环保厅的挂牌督办，还是安徽省地方环保部门的行政处罚，均未在招股书中披露。国祯环保表示，公司生产经营活动过程严格遵守国家环境保护法律法规，报告期内无环境污染事故，并罗列了一些环保部门对其子公司的证明文件。但记者注意到，其委托经营的污水处理厂并没有得到所在地环保部门的背书文件，如关于临泉厂就没有任何证明文件。
